Mengikut rekod asal, Sekolah Kebangsaan Lembah
Jaya mula dibina pada 15 Februari 2002 di kawasan seluas 4 hektar
di Kampung Lembah Dener. Nama Sekolah Kebangsaan Lembah Jaya telah
diinspirasikan oleh Penolong Pegawai Pendidikan Daerah Setiu pada waktu itu
iaitu Tuan Haji Romeli bin Ismail yang ingin melihat kecemerlangan
pendidikan berterusan di daerah ini.
Nama sekolah ini dicipta sebagai merealisasikan aspirasi beliau untuk
menjadikan Setiu sebagai daerah nombor satu di Malaysia dalam bidang
pendidikan. Sekolah ini memulakan sesi persekolahannya
pada 4 Januari 2004. Sekolah ini mengorak langkah pertama dengan 6 buah kelas
iaitu dari tahun satu hingga tahun enam. Seramai 189 orang murid, 15 orang guru
serta 3 orang kakitangan sokongan merupakan warga sulung sekolah ini.
Guru Besar pertama yang diberi mandat untuk
menerajui tampuk kepimpinan Sekolah Kebangsaan Lembah Jaya ialah En. Mohd
Tarmizi bin Haji Selamat.
Manakala, Pengerusi Persatuan Ibu Bapa
dan Guru (PIBG) yang pertama dilantik sebaik sekolah ini beroperasi ialah En. Samion bin Salleh, merangkap
Penolong Pegawai Daerah Setiu. Pembukaan sesi
persekolahan dirasmikan dengan kehadiran Timbalan Ketua
Pengarah Pelajaran Malaysia (Jabatan Sekolah) iaitu Yang Berbahagia Dato’
Haji Kusaini Bin Haji Hasbullah.